Первый съезд Всемирного конгресса бухарских евреев состоялся 23 ноября 2000 года. С тех пор ежегодно его посещают делегаты из США, Израиля, Узбекистана, Австрии, России, Германии и Гонконга. Президентом Конгресса избран известный бизнесмен Леви Леваев. В состав президиума вошли все руководители региональных конгрессов, бизнесмены и общественные деятели.

Приоритетными направлениями деятельности Конгресса являются сохранение духовного наследия и национальной культуры бухарских евреев, возвращение к своим историческим корням. Оказывается социальная и финансовая помощь нуждающимся, поддержка подрастающего поколения (в том числе в виде стипендий для талантлиых студентов). Конгресс  издает газету "Менора", которая объединяет десятки тысяч читателей во всем мире.